应用化学系是学校最早创办的系、部之一，应用化学专业是我校具有70余年办学历史的具有一定优势和特色的专业，其主要分油田化学和分析化学两个方向，为石油、冶金等行业培养了3000余名学生，深受企业的欢迎。

应用化学系目前拥有一支数量合理、结构优化、水平较高、创新意识浓厚、相对稳定的科技创新队伍。现有固定的专职教师24名，其中教授4人，正高级工程师2人，副教授7人，高级（程师2人，高级职称共15名，占62.5%，具有博士学位的成员19名，硕士学位的成员6名；具有海外留学（进修）经历的教师6名，重庆市高校中青年骨干教师及重庆市学术技术带头人后备人选1人。教师队伍层次、结构合理。

近些年，应化系教师主持了国家自然科学基金项目4项，其中青年基金3项，面上基金1项，参与国家重大专项子课题1项，重大子课题外协项目2项，省部级项目和横向合作项目30余项，年均科研经费600万元；发表学术论文30余篇，其中SCI收录21篇，EI收录3篇；申请发明专利20余项，获得授权7项；油气田化学方向教师在煤层气压裂液体系、页岩气压裂液体系方面取得突破，产品得到现场应用，成果转移收入达1.06亿元。

经过60年的建设与发展，应用化学系建成了油气田应用化学专业实验室和环境工程专业实验室。依托油气田应用化学专业实验室，应用化学系成功申请并获批重庆市油气田化学工程技术研究中心，该中心有包括合成、表征和测试三大功能设备1000余台（套），设备总值1600余万元，5万元以上的设备43台套，其中50万元以上的9台套，20-50万元的设备18台套。拥有包括LC-MS，GC-MS，ICP-MS，电化学工作站、离子色谱、高效液相色谱仪、气相色谱仪、有机元素分析仪、红外光谱、原子吸收仪、紫外分光光度仪、SD型多联中压失水仪、粘滞系数测定仪NZ－3A、高温高压失水仪、岩心流动实验装置、哈克流变仪、SC-1001-20气相色谱仪、NOVA2000e全自动比表面分仪、winner2000台式激光粒度计、高温高压流变7400、酸岩反应试验装置、旋转粘度计RV-100、XL30扫描电子显微镜等分析测试与油气田储层评价等大型实验设备。依托这些先进的实验设备，可开展钻井完井液技术、酸化压裂技术、强化采油技术腐蚀防腐技术、工业分析等方向的研究，为教师科研和学生科技创新提供一个良好的平台。应用化学专业经过多年发展，已成为我市油气田化学人才的重要培育基地，为我国和西南油气田的跨越式发展提供丰富的专业人才资源和强有力的现代应用化学技术支持。依托环境工程专业实验室，应用化学系初步建立起三大环境工程平台，即土壤风险评估和污染土壤治理平台、水污染治理平台和大气污染与防治平台；其中土壤治理平台具备重庆市污染土壤风险评估和污染土壤治理修复双甲级资质，并承担了多项重庆市的污染土壤风险评估和污染土壤治理,形成了对不同特征污染土壤的治理修复技术；水污染治理平台以油气田的勘探、开发、钢铁冶金过程中的水环境污染治理为主要研究领域，开展了钻井液的回收再利用、压裂液返排水回收利用等技术研究，为石油开采等行业的生态风险评估与污染控制管理提供技术支撑；大气治理平台通过建设拥有国内外先进的气体污染物检测分析仪器，可以对氮氧化物、二氧化硫、一氧化碳、烟尘等常规大气污染物进行检测和分析，此外在对石油天油气净化过程中的脱硫净化研究的过程中，建立了一套从理论到实践的脱硫过程建模与工艺参数优化的技术路线，研究水平在重庆地区处于前列。